DATE

14 to 19 May, 2020

I. Introduction

La RDC est un pays touché par la pandémie de COVID-19.

Le diagnostic et le suivi des patients ne se font pour le moment que dans le laboratoire de l'INRB Kinshasa.

Afin de décentraliser les activités de diagnostic et de suivi des patients atteints de coronavirus, le ministère de la Santé et ses partenaires travaillent à étendre la plateforme technique de certains laboratoires leur permettant d'effectuer le diagnostic et le suivi des patients.

Pour identifier les laboratoires pouvant rejoindre ce cercle, une évaluation de base des conditions requises pour un laboratoire leur permettant d'effectuer le test est nécessaire.

Dans ce contexte, le GHSS, partenaire d'appui du CDC pour les activités du laboratoire, en partenariat avec CDC - RDC et le MOH RDC travaillant au renforcement des systèmes de laboratoire en RDC a été appelé à évaluer des laboratoires à Kinshasa et dans les provinces avec le soutien du PEPFAR.

Aidé par l'outil d'évaluation des laboratoires de l'OMS pour les laboratoires mettant en œuvre des tests de dépistage du virus COVID-19, la visite en laboratoire a donné les résultats que nous publions dans cet article.

II.MATERIELS ET METHODES

Il s'agit dune étude prospective, descriptive et analytique réalisée du 15 Mai au 19 Mai 2020 par les staff GHSS RDC , DR vital nkake directeur technique et DR rodrigue NAKASALA coordinator des activites qualités à travers les differents laboratoires de la ville de Kinshasa selectionnés par pepfar grâce a l’ Outil d’évaluation en laboratoire de l’OMS pour les laboratoires mettant en œuvre des tests de dépistage du virus COVID-19, Cet outil a été conçu pour évaluer la capacité des laboratoires qui ont mis en œuvre ou ont l'intention de mettre en œuvre des tests pour le SRAS-CoV-2, le virus qui cause la nouvelle maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). Les questions des onglets 1 à 10 de l'outil sont destinées à faciliter l'évaluation des capacités de base du laboratoire et peuvent inclure, sans s'y limiter, les tests COVID-19. Les questions de l'onglet 11 traitent des spécificités liées aux tests du virus COVID-19.

La liste suivante de laboratoires a été envoyée au GHSS pour mener des enquêtes dans les provinces avec le soutien du PEPFAR.

Tableau 1: Liste des laboratoires à évaluer

Detailed list of conventional Laboratories and Equipment and POC in the PEPFAR Provinces for the COVID-19 project
PROVINCES	ZS	AS	LABORATORIES / FOSA	PRIMARY EQUIP	NUMBER		PRESENCE OF BSC	TYPE OF LABORATORIES
Kinshasa (KIN)	-	-	INRB	ABI Thermocycler	5		OUI	BSL 3 , BSL 2
	-	-	LNRS / PNLS	M2000rt/sp	1		OUI	BSL 2
	-	-	UM1, UM2	GeneXpert 4-modules	2		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Ndjili	-	Hôpital de l'Amitié Sino-Congolaise	-	0		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	-	-	LNRM / PNLT	GeneXpert 16-modules	1		OUI	BSL 3 , BSL 2
	Barumbu	Bitshakutshaku	Boyambi Hôpital Général de Réference	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Bumbu	Matadi 2	Libondi Centre de Santé	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kalamu 1	Kimbangu 2	Bondeko Centre de Santé	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Lemba	Molo	Lisanga Centre de Santé	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Lemba	Molo	Lisanga Centre de Santé	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Mont Ngafula 1	Monkole	Centre Hospitalier Monkole	GeneXpert 2-modules	1		OUI	BSL 2
	Mont Ngafula 2	Kimbondo	Pediatries de Kimbondo Hôpital	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Bandalungwa	Bisengo	Libikisi Centre de Santé	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Binza Meteo	Binza Pigeon	Saint Sacrement Centre de Santé	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kikimi	Bosembo	Kikimi Centre Hospitalier	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kimbanseke	Mangana	Boyokani Centre de Santé	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kingabwa	Mayamba	Liziba Lya Bomoi Centre Hospitalier	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kingasani	17 Mai	Kingasani Centre Hospitalier	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Limete	Industrielle 1	2Eme Rue Centre de Santé	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Limete	Industrielle 1	1Ere HJ Hospital	GeneXpert 2-modules	1		OUI	BSL 2
	Lingwala	La Voix Du Peule	Hôpital CDT Kabinda Centre Hospitalier (MSF)	M2000rt/sp	1		OUI	BSL 2
				GeneXpert 4-modules	2		OUI	BSL 2
	Masina 1	Boba	Roi Baundouin 1Er Centre Hospitalier	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Masina 1	Imbali	Bolingo Centre de Santé	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Masina 2	Tshuenge	Elonga Centre de Santé	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Matete	Mbomb Ipoko	St Alphonse Centre de Santé	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Ndjili	Quartier 2	Bomoi Centre de Santé	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Ngaba	Mukulua	CME Ngaba Hopital	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Nsele	Mikala	Etonga Centre Hospitalier	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Nsele	Pecheur	Dream Centre de Santé	M2000rt/sp	1		OUI	BSL 2
				GeneXpert 4-modules	1		OUI	BSL 2
Haut Katanga (HKT)	Lubumbashi	Lubumbashi	L’Shi / LPRS	M2000rt/sp	1		OUI	BSL 2
	Lubumbashi	Lubumbashi	L'Shi / LPR TB	GeneXpert 4-modules	1		OUI	BSL 2
	Kasenga	Mission	Kaboka Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kenya	Kenya 2	Kenya Hôpital Gérérale de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kikula	Musumba	Daco Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kilwa	Kilwa	Kilwa Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Mufunga Sampwe	Kipanga	Mufunga Sampwe Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Sakania	Kasumba Lesa douane	Kasumbalesa Douane Centre de Santé de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Vangu	Kimbeimbe	Ruashi Hôpital Militaire de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
Lualaba (LLB)	Kapanga	Nswan Mulapu	Kapanga Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Fungurume	Dipeta 1	ISOS Hôpital	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kasaji	Niche	Kasaji Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Manika	HGR Mwangeji	Kolwezi \| LPR (dans Mwangeji Hôpital Général de Référence)	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
Ituri (ITR)	Ariwara	Ariwara	Ariwara St. Bakhita Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Aru	Bakhita	Aru Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Bambu	Bambu	Bambu Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Bunia	Bigo	Bunia \| LPR (à côté de Bunia Hôpital Général de Référence)	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Mahagi	Mahagi Anglican	Mahagi Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Mambasa	Mambasa	Mambasa Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
Nord Kivu (NKV)	Beni	Kanzulinzuli	Beni Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Goma	Heal Africa	Goma \| LPR (à côté de Nord-Kivu Hôpital Provincial de Référence \| AMI-LABO)	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
				Smart Cycler	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Karisimbi	Virunga	Virunga Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Katwa	Masuli	Katwa Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
Sud Kivu (SKV)	-	-	Bukavu \| LPR (éloigné des CSDT)	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	-	-	HPGRB	GeneXpert 2-modules	1		OUI	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Fizi	Baraka	Baraka Hôpital	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Ibanda	Panzi	Panzi Hôpital Général de Référence	GeneXpert 4-modules	1		OUI	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Idjwi	Mpene	Monvu Hôpital Général de Référence	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kamituga	Kabukungu	Kamituga Hôpital Général de Référence	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Katana	Ciranga	Fomulac Hôpital Général de Référence	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Kimbi Lulenge	Lulimba	Lulimba Centre Hôspitalier	GeneXpert 4-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Nyantende	Nyantende	Nyantende Hôpital Général de Référence	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Shabunda	Mbangayo	Shabunda Hôpital Général de Référence	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
	Walungu	Walungu	Walungu Hôpital Général de Référence	GeneXpert 2-modules	1		NON	LABO TYPE 1 Ordinaire
TOTAL					71	13

III.RESULTATS ET DISCUSSION

III.1. Laboratories and primary equipment per provinces

Tableau 3: Laboratoires et type d'équipement principal

Provinces	Nombre Labos avec Equipement Primaire	Type d'Equipement Primaire
Provinces	Nombre Labos avec Equipement Primaire	ABI Thermo cycler	M2000rt/sp	Smart Cycler	GeneXpert 16-Modules	GeneXpert 4- Modules	GeneXpert 2- Modules	Total Equipement
KINSHASA	32	5	3	0	1	18	9	36
HAUT KATANGA	9	0	1	0	0	8	0	9
LUALABA	4	0	0	0	0	4	0	4
ITURI	6	0	0	0	0	6	0	6
NORD KIVU	4	0	0	1	0	4	0	5
SUD KIVU	11	0	0	0	0	3	8	11
TOTAL	66	5	4	1	1	43	17	71

Dans les 6 provinces bénéficiant du soutien du PEPFAR pour les activités de laboratoire dans le cadre de COVID-19, il existe 66 laboratoires avec 71 équipements principaux, notamment: 5 thermocycleurs ABI, 4 m2000rt / sp, 1 Smart Cycler, 1 modules GeneXpert 16, 43 modules GeneXpert 4 et 17 GeneXpert 2 modules.

Fig.1: Nombre de laboratoires avec l'équipement principal sélectionné

Commentaires: Kinshasa possède 32 laboratoires avec des équipements primaires, Sud Kivu 11, Haut Katanga 9, Ituri 6 et Nord Kivu et Lualaba seulement 4.

Fig.2: Type et nombre d'équipements primaires sélectionnés par laboratoire

Commentaires: Kinshasa possède tout l'équipement majeur et la province du Haut Katanga a une machine m2000rt / sp et la GeneXpert, celle du Nord Kivu a une machine Smart Cycler et la GeneXpert. Les autres provinces ne disposent que de machines GeneXpert.

III.2 Laboratoires et niveau de biosecurité

Tableau 4: Niveau des laboratoires et BSC

Provinces	Nombre Labos avec Equipement Primaire	Nombre de Labos avec Présence de BSC	Type de Laboratoire
Provinces	Nombre Labos avec Equipement Primaire	Nombre de Labos avec Présence de BSC	BSL 3	BSL 2	Labo Type 1 Ordinaire
KINSHASA	32	9	2	9	22
HAUT KATANGA	9	2	0	2	7
LUALABA	4	0	0	0	4
ITURI	6	0	0	0	6
NORD KIVU	4	0	0	0	5
SUD KIVU	11	2	0	0	11
TOTAL	66	13	2	11	55

Fig 3: nombre des laboratoires avec BSC

Commentaires: Seuls 13 laboratoires ont un BSC, dont 9 à Kinshasa, 2 au Haut Katanga et 2 au Sud-Kivu.

Fig. 4: Nombre de laboratoires et niveau de sécurité

Commentaires: Il existe des laboratoires de niveau BSL3 (2 à Kinshasa), des laboratoires de niveau BSL 2 (9 à Kinshasa et 2 dans le Haut Katanga) et le reste des laboratoires sont de type 1 ordinaire.

I.3 Résumé de l'évaluation des laboratoires à Kinshasa

L'évaluation a été réalisée sur 3 catégories de laboratoires:

- Laboratoire avec un paquet minimum sur la biosécurité et la surveillance de la qualité

- Laboratoire d'un HGR

- Laboratoire d'un centre de santé équipé de matériel de base.

En utilisant la liste de contrôle intelligente de l'OMS, les résultats suivants ont été trouvés:

III.3.1 Indicateur moyen des capacités du laboratoire

Le tableau ci-dessous résume l'évaluation des laboratoires.

Tableau 5: Performance des laboratoires après évaluation

RAPPORT SOMMAIRE DE L'ÉVALUATION DE LABORATOIRE

LABORATORIES		LNRM PNLT	MSF-B KABINDA	CHME MONKOLE	LNRS KIN	DREAM KIN	HASC KIN	CS BOMOI Kin
SN	Average indicator for the laboratory core capacities	82%	83%	87%	84%	84%	51%	43%
1	Organization and management	61%	83%	78%	61%	73%	29%	32%
2	Documents	80%	75%	90%	78%	95%	15%	25%
3	Specimen collection, handling and transport	80%	86%	90%	95%	85%	75%	61%
4	Data and information management	81%	100%	88%	85%	88%	69%	68%
5	Consumables and reagents management	90%	95%	95%	90%	95%	85%	80%
6	Equipment management	83%	75%	92%	88%	75%	45%	42%
7	Facilities	92%	93%	98%	87%	88%	54%	43%
8	Human resources	88%	88%	85%	81%	85%	27%	12%
8	Bio risk management	64%	64%	74%	74%	76%	48%	30%
10	Public health functions	100%	65%	83%	100%	83%	58%	40%
11	COVID-19 testing capacity and capability

Commentaires: Sur les 7 laboratoires visités, 5 sont des laboratoires de biologie moléculaire avec un ensemble minimum de capacités de biosécurité avec contrôle de la qualité, 1 laboratoire HGR et 1 laboratoire de centre de santé.

Fig 5: Indicateur moyen des capacités de base du laboratoire

Commentaires: Après évaluation, le laboratoire du CHME à Monkole a reçu 87% suivi des laboratoires du LNRS et Dream Kinshasa avec 84%, MSF-B 83%, LNRM / PNLT 82%, le laboratoire HASC Ndjili avec 51% et enfin le laboratoire de le centre de santé de Bomoi avec 43%.

Cela montre que les laboratoires de biologie moléculaire ayant la capacité d'effectuer des analyses de biologie moléculaire en termes d'équipement et de formation du personnel ont une forte probabilité de faire également des tests sur COVID-19.

De plus, ce sont des laboratoires suivis sur les normes de biosécurité et de gestion de la qualité mais aussi sur le processus d'accréditation.

Fig 6: Indicateur des capacités de base du laboratoire

Commentaires: Tous les indicateurs ont reçu, en moyenne, la même note au niveau du laboratoire de biologie moléculaire et moins de points dans les laboratoires du HGR et du centre de santé.

De tous les indicateurs clés analysés, l'indicateur lié à la gestion des données, réactifs, consommables et équipements, mais aussi aux fonctions de santé publique a été mieux suivi dans les laboratoires.

Fig 7: Indicateur des capacités de base du laboratoire (par laboratoire)

Commentaires: Les laboratoires non-biologie moleculaire ont une faiblesse dans les indicateurs, notamment en ce qui concerne la biosécurité et la qualité du travail car ils ne sont pas formés et soutenus dans ce sens.

 III.3.2 Capacité technique des laboratoires dans le domaine de l'analyse COVID-19

Fig 6: Capacités techniques du laboratoire

Commentaires: Les laboratoires de biologie moléculaire (CHME Monkole, LNRS, MSF-B, DREAM, LNRM) disposent de toutes les capacités techniques et des équipements pour réaliser des tests biomoléculaires et sérologiques.

Le laboratoire HASC n'a de capacité que pour la réalisation de sérologie ordinaire et n'est pas de capacité pour la biologie moléculaire.

Le laboratoire CS Bomoi n'a ni biomol ni capacité sérologique, mais est capable de réaliser des examens avec le POC GeneXpert.

IV. CONCLUSION ET RECOMMANDATION

Mettre les centres de diagnostic de COVID-19 dans les laboratoires avec un bon score après évaluation: LNRM / PNLT, CHME Monkole, MSF-B, LNRS et DREAM. Ø La possibilité de mettre en place un centre de diagnostic dans les laboratoires du HGR et du centre de santé avec POC n'est possible que s'il existe un minimum de sécurité biologique et de qualité de laboratoire et un suivi régulier de ses laboratoires avec des restrictions d'accès

V.REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES

1. World Health Organization, Laboratory biosafety guidance related to

Coronavirus disease (COVID-19) Interim guidance19 March 2020.

2. WHO-2019-nCoV-Lab_Assessment_Tool_Data-2020.1-english

3. CDC-PEPFAR, Liste detaillée des équipements conventionnels dans les Provinces PEPFAR sous le projet COVID-19.

Article disponible sur demande